La Commission est chargée d'étudier les demandes d'homologation des produits pharmaceutiques et de proposer au Ministre chargé de la santé publique des avis économiques, techniques ou scientifiques en vue de la mise sur la marché desdits produits.
Elle comprend en son sein les commissions spécialisées dans les domaines ci-après :
- examen des demandes d'homologation des produits pharmaceutiques ;
- pharmacovigilance et pharmacopée traditionnelle ;
- phytothérapie et techniques thérapeutiques alternatives ;
- Spécialités cliniques et santé communautaire ;
- Radiologie et imagerie médicale ;
- Réactifs biomédicaux ;
- Consommables biomédicaux ;
- Sélection et révision de la liste nationale des médicaments et vaccins essentiels, du formulaire national et du guide thérapeutique national.